Wiele lat, a nawet kilka nowych pokoleń po rządach uwielbianego Cezara, małpy są dominującym i harmonijnym gatunkiem, podczas gdy ludzie są zmuszeni do ukrywania się.
Podczas gdy despotyczny i bezwzględny nowy przywódca małp buduje swoje wspaniałe imperium, pewna młoda małpa wyrusza w przerażającą podróż, która zmusi ją do zakwestionowania wszystkiego, co wiedziała i czego nauczono ją o przeszłości oraz do podjęcia trudnych wyborów, które zadecydują o przyszłości zarówno małp, jak i ludzi.
W bezpośredniej kontynuacji filmu Wojna o planetę małp z 2017 roku i czwartej części franczyzy Planeta małp, zwykły szympans łączy siły z młodą dziewczyną, próbując określić przyszłość małp i ludzkości.