W dniu 8 lipca 1923 r. Ogród Botaniczny został oficjalnie otwarty wraz z położeniem kamienia węgielnego pod budowę oranżerii przez prezydenta Aleksandrasa Stulginskisa.
W latach 1923-1925 Ogród Botaniczny zbudował swoje pierwsze szklarnie, oranżerię, która składała się z czterech pomieszczeń o stałej temperaturze i basenu dla roślin tropikalnych. Rosło tu 1770 różnych gatunków roślin. W pierwszym roku działalności Ogród Botaniczny odwiedziło pięć tysięcy gości, a z biegiem lat stał się on nie tylko bazą edukacyjną dla studentów biologii, medycyny i farmacji, ale także ważnym ośrodkiem nauk botanicznych.
Ogród Botaniczny VMU jest obecnie największym ogrodem zimowym na Litwie (1093 m2 powierzchni) i posiada ponad 1000 gatunków roślin (1300 numerów kolekcji). Oddzielne sekcje prezentują rośliny z chłodnych tropików, ciepłych tropików, lasów deszczowych, lasów tropikalnych, tropików wilgotnych, pustyń i półpustyń.
