Był słoweńskim księdzem rzymskokatolickim, kompozytorem i nauczycielem muzyki. Najbardziej znany jest jako kompozytor muzyki do słoweńskiego hymnu narodowego "Zdravljica".
Premrl urodził się w wiosce Šent Vid (obecnie Podnanos) w górnej dolinie Vipavy, w ówczesnym austro-węgierskim księstwie Carniola (obecnie w Słowenii).
Ukończył konserwatorium muzyczne w Wiedniu. W latach 1909-1939 pełnił funkcję dyrektora muzycznego w katedrze w Lublanie. W latach 1908-1939 był dyrektorem szkoły organowej w Lublanie.
Miał znaczący wpływ na rozwój słoweńskiej muzyki kościelnej. Był jednym z najbardziej płodnych słoweńskich kompozytorów XX wieku, publikując ponad 2000 utworów. 24 września 1905 roku skomponował muzykę do patriotycznego poematu France Prešerena Zdravljica. Kompozycja Premrla szybko stała się najpopularniejszą muzyką do tej pieśni; do lat 40. stała się jedną z najpopularniejszych słoweńskich pieśni patriotycznych. W 1989 roku została oficjalnie przyjęta jako regionalny hymn Socjalistycznej Republiki Słowenii, będącej wówczas częścią Jugosławii. W 1991 roku stała się hymnem narodowym niepodległej Słowenii.
Stanko Premrl był wujem słoweńskiego partyzanta Janko Premrla, znanego również jako Vojko.
