Yannick pracował z wieloma czołowymi europejskimi zespołami i cieszy się bliską współpracą z Berliner Philharmoniker, Wiener Philharmoniker, Bayerischer Rundfunk Sinfonieorchester i Chamber Orchestra of Europe; w latach 2008-2014 był także głównym dyrygentem gościnnym London Philharmonic Orchestra. Wielokrotnie występował na BBC Proms i wielu europejskich festiwalach, w tym w Edynburgu, Lucernie, Salzburgu i Grafenegg (Wiedeń). Letnie występy w Ameryce Północnej obejmują nowojorski Mostly Mozart Festival, Lanaudiere, Vail i Saratoga oraz Domaine Forget Festival w Charlevoix. Wraz z Philadelphia Orchestra regularnie występuje w Carnegie Hall, gdzie w latach 2019-2020 pełnił funkcję Perspectives Artist. Prowadzi również kursy mistrzowskie, zwłaszcza w dwóch najbardziej renomowanych instytucjach, Curtis Institute w Filadelfii i Julliard School w Nowym Jorku. W Quebecu kieruje akademią młodych dyrygentów związaną z Orchestre Métropolitain, w ścisłej współpracy z Domaine Forget Summer Festival.
Długoletnia współpraca z letnim festiwalem w Baden Baden, La Capitale d'été, zaowocowała kilkoma koncertami i nagraniami oper z Chamber Orchestra of Europe (patrz następny akapit), a także kompletem symfonii Beethovena (lato 2021) i cyklem Brahmsa (lato 2022 i 2023).
Regularnie dyryguje orkiestrami filadelfijską i rotterdamską, a także Chamber Orchestra of Europe podczas tras koncertowych po Azji i Europie; w listopadzie 2017 r. dyrygował Orchester Métropolitain de Montréal podczas jej pierwszej europejskiej trasy koncertowej, która okazała się ogromnym sukcesem, a następnie, w listopadzie 2019 r., podczas bardzo prestiżowej amerykańskiej trasy koncertowej ze śpiewaczką Joyce DiDonato; planowana jest druga amerykańska trasa koncertowa z Orchestre Métropolitain, która zabierze ich do Carnegie Hall w marcu 2024 roku. Latem 2023 r. poprowadził bardzo udane europejskie tournée z Orkiestrą MET, która nie podróżowała od wielu lat; planowana jest trasa azjatycka.
Yannick czuje się równie dobrze w operze, jak i na koncercie. Po tym jak w latach 2000-2004 występował w Opéra de Montréal w L'Incoronazione di Poppea, Bursztynie sewilskim, Cosi fan tutte, Pelléas et Mélisande i L'Elisir d' amore, powraca sporadycznie w Wozzeck, Madame Butterfly, Salomé i Elektra. Zadebiutował na Festiwalu w Salzburgu w 2008 roku z nową produkcją Romea i Julii Gounoda i powrócił tam w 2010 i 2011 roku z Don Giovannim Mozarta. W sezonie 2009-2010 zadebiutował w Metropolitan Opera (MET) w nowej produkcji Carmen Bizeta; Następnie powracał tam w każdym sezonie, aby dyrygować Don Carlo, Faust, La Traviata, Rusałka, Otello, Der Fliegende Hollander, Parsifal i Elektra, zanim został dyrektorem muzycznym; Na tym stanowisku dyrygował La Traviata, Pelléas et Mélisande, Dialogues des Carmélites, Turandot, Wozzeck, Tosca, Fire shut up in my bones, Eurydice i Don Carlo (w języku francuskim). Ponadto w sezonie 2022-2023 poprowadzi kolejno Godziny, Lohengrina, Championa i La Bohême. W sezonie 2023-2024 poprowadzi Dead Man Walking, Florencia in el Amazonas, La Forza del Destino i Roméo et Juliette
Dyrygował w Teatro alla Scala (Mediolan), Royal Opera House (Covent Garden, Londyn), Netherlands Opera (Amsterdam) i Vienna Staatsoper (Wiedeń). Z Rotterdams Philharmonisch Orkest, tuż przed rozpoczęciem pandemii, dyrygował półsceniczną wersją Die fraù ohne schatten Richarda Straussa. W 2011 roku podjął się cyklu ostatnich oper Mozarta dla Festspielhaus Baden Baden, wszystkie nagrane "na żywo" przez Deutsche Grammophon; do tej pory ukazały się następujące tytuły: Di Zauberflöte; La Clemenza di Tito; Le Nozze di Figaro; Entführung aus dem Serail; Cosi fan tutte; Don Giovanni, większość z nich z Chamber Orchestra of Europe. W kwietniu 2022 roku wraz z Rotterdams Philharmonisc Orkest dyrygował Rheingold Richarda Wagnera w wersji koncertowej podczas trasy koncertowej w Rotterdamie, Paryżu, Dortmundzie i Baden Baden, która przyniosła najwyższe uznanie dla całej produkcji. Podobna trasa jest planowana z Walküre Richarda Wagnera w marcu 2024 r.
Na temat kariery Yannicka Nézet-Séguina nakręcono kilka filmów lub sekwencji, z których najpełniejszy, wydany w 2021 r., zatytułowany Yannick, an Artist's Journey autorstwa Susan Froamke, wyprodukowany przez MET. Ponadto Yannick uczestniczył jako konsultant dyrygencki w 2022 i 2023 roku w produkcji dwóch filmów: Maestro, amerykański film Bradleya Coopera (który gra również tytułową rolę), z Carrie Mulligan w roli głównej, opowiadający o życiu Leonarda Bernsteina (na Netflix w listopadzie 2024 r.); oraz Happy Days, film z Quebecu w reżyserii Chloé Robichaud z Sophie Desmarais w roli młodej dyrygentki.
Maestro nagrywa wyłącznie dla Deutsche Grammophon. We wrześniu 2013 roku ukazało się jego pierwsze nagranie symfoniczne pod tym prestiżowym szyldem; z tej okazji dyryguje orkiestrą filadelfijską, która nie nagrywała pod szyldem renomowanej wytwórni od 1997 roku; ich płyta Stravinsky (Święto wiosny)- Stokowski (transkrypcje Bacha i Strawińskiego) okazała się ogromnym sukcesem. Z Chamber of Europe Orchestra nagrał komplet Symfonii Mendelssohna, jak również komplet dzieł Symfonii Schumanna; z Rotterdams Philhamonisch Orkest, souvenir box; z Daniilem Trifonovem i Philadelphia Orchestra, dwie płyty 4 koncertów fortepianowych Rachmaninowa. Jego dyskografia DG obejmuje kilka innych nagrań, w tym Tchaikovsky z Lisą Batiashvili i Rotterdam Philharmonic Orchestra; oraz Visions of Prokofiev z Lisą Batiashvili i Chamber Orchestra of Europe. Po kilku występach scenicznych Mass Leonarda Bernsteina, Yannick dyryguje Orkiestrą Filadelfijską, a także wszystkimi uczestnikami nagrania, które zostało wydane w marcu 2018 roku. W 2021 roku, nadal z Orkiestrą Filadelfijską, nagrywa Symfonie 1 i 3 Florence Price; płyta ta przyniosła mu nagrodę Grammy za "najlepsze wykonanie orkiestrowe". Z tą samą orkiestrą nagrał album Price-Dawson, nominowany do nagrody Grammy w 2024 roku.
Wraz z ATMA Classique i Orchester Métropolitain de Montréal, z którymi zaczął nagrywać w 2000 roku, specjalny box set zbiera wszystkie Bruckner Symphonies nagrane na przestrzeni lat. Następnie podjął z nimi Cycle Sibelius, którego najnowszy album ukaże się w 2024 roku. Powrót do gry na fortepianie podczas pandemii pozwala jego pierwszemu solowemu albumowi fortepianowemu, Introspection, ujrzeć światło dzienne w Deutsche Grammophon (luty 2021). Inne nagrania są dostępne w różnych wytwórniach: Rotterdam Philharmonic Orchestra (EMI Classics, BIS); London Philharmonic Orchestra (LPO label); Montreal Metropolitan Orchestra (ATMA Classic); Berliner Philharmoniker (house label); Wiener Philharmoniker (Sony Classical); etc
