Był włoskim malarzem okresu renesansu, aktywnym w Mediolanie i jego okolicach.
Chociaż był prawie współczesny Leonardo da Vinci, malował w stylu bardziej zbliżonym do przedrenesansowej, lombardzkiej sztuki Vincenzo Foppa i Bernardino Zenale. Daty jego narodzin i śmierci nie są znane; mówi się, że urodził się w Fossano w Piemoncie, a jego przydomek przypisuje się jego artystycznej przynależności do szkoły burgundzkiej.
Jego sława jest głównie związana z jego pracą w kompleksie Certosa di Pavia, składającym się z kościoła i klasztoru kartuzów. Jest mało prawdopodobne, aby w 1473 roku zaprojektował słynną fasadę samej Certosy. Pracował tam przez osiem lat, począwszy od 1486 roku, we współpracy ze swoim bratem Bernardino Bergognone, kiedy to dostarczył projekty postaci dziewicy, świętych i apostołów do stall chórowych, wykonanych w tarsji lub inkrustowanej stolarce przez Bartolomeo Pola, aż do 1494 roku, kiedy to wrócił do Mediolanu. Tylko jeden znany obraz, ołtarz w bazylice Sant' Eustorgio, można z dużym prawdopodobieństwem przypisać do okresu jego kariery wcześniejszego niż 1486 r.
Cristo in pietà sorretto dalle donne, Accademia Carrara (detal)
Przez dwa lata po powrocie do Mediolanu pracował w kościele San Satiro. Od 1497 roku przez pewien czas zajmował się dekoracją malarską kościoła Incoronata w sąsiednim Lodi. Dokumentacja na jego temat jest skąpa. W 1508 r. malował dla kościoła w Bergamo; w 1512 r. jego podpis pojawia się w publicznym dokumencie Mediolanu; w 1524 r. - i jest to nasz ostatni autentyczny zapis - namalował serię fresków ilustrujących życie świętego Sisiniusa w portyku San Simpliciano w Mediolanie. Borgognone jest uważany za skromnie utalentowanego malarza o wyraźnej indywidualności. Zajmuje interesujące miejsce w najciekawszym okresie sztuki włoskiej.
Galeria Narodowa w Londynie posiada szereg jego dzieł: oddzielne fragmenty jedwabnego sztandaru namalowanego dla Certosa i zawierającego głowy dwóch klęczących grup mężczyzn i kobiet oraz duży ołtarz zaślubin św. Katarzyny, namalowany dla kaplicy Rebecchino w pobliżu Pawii.
Ale aby ocenić jego prawdziwe moce i osobliwe ideały, jego system słabych i wyraźnych kolorów, czy to we fresku, temperze czy oleju; jego nieco smukłe i blade typy, nie bez czegoś, co przypomina nam sztukę północną w ich teutońskim sentymentalizmie, jak również ich wierność portretowania; konflikt jego instynktownej miłości do spokoju i spokoju z nieco wymuszoną i zapożyczoną energią w postaciach, w których wymagana jest energia, jego konserwatyzm w kwestii piętrowych i drobiazgowo zróżnicowanych teł, aby ocenić te cechy mistrza takimi, jakimi są, konieczne jest przestudiowanie najpierw wielkiej serii jego fresków i ołtarzy w Certosa, a następnie tych pozostałości późniejszych fresków i ołtarzy w Mediolanie i Lodi, w których odnajdujemy wpływ Leonarda i nowych czasów mieszających się z, ale nie usuwających, jego pierwszych upodobań