Był czeskim reżyserem filmowym, scenarzystą i aktorem. Wyreżyserował filmy w Czechosłowacji, Stanach Zjednoczonych i Niemczech, w tym Erotikon i Ecstasy.
Urodził się jako Augustín Otokar Jan Machatý w Pradze. Jego ojciec był inwestorem na rynku nieruchomości. Machatý nie ukończył szkoły średniej i zaczął pracować w filmach jako nastolatek. Pracował jako pianista kinowy, aktor, scenarzysta, producent i dyrektor artystyczny.
W 1919 roku wyreżyserował swój pierwszy film Teddy by kouřil. W 1920 roku wyjechał do USA, pracował dla Universal Pictures i wrócił w 1922 roku. W 1926 roku w końcu udało mu się zdobyć fundusze na film Sonata Kreutzerowska. Film okazał się sukcesem i sprawił, że Machatý otrzymał propozycje reżyserowania. Jego kolejny film Schweik in Civilian Life nie odniósł sukcesu. Machatý spędził dwa lata studiując zagraniczne filmy i wkroczył w okres, w którym nakręcił najlepsze filmy w swojej karierze. W 1929 r. nakręcił symbolistyczny dramat Erotikon, w 1931 r. dramat społeczny Od soboty do niedzieli i adaptację powieści Karela Poláčka Načeradec, král kibiců, a w 1933 r. jego najbardziej znany film Ecstasy.
Ecstasy został pokazany na festiwalu filmowym w Wenecji i przyniósł zarówno Machatý'emu, jak i jego głównej aktorce Hedy Lamarr międzynarodową sławę. Oboje otrzymali propozycję pracy dla Metro-Goldwyn-Mayer. Po nakręceniu Nocturno w Niemczech i Ballerine we Włoszech zdecydował się przyjąć ofertę i wyjechał do USA. Jednak jego amerykańska kariera była wypełniona jedynie pracą kontraktową na niskim poziomie dla studia, a producenci MGM nie byli zainteresowani jego pomysłami. W latach 1940-1943 pracował dla RKO, reżyserując jedynie próbne filmy z początkującymi aktorami. W 1945 roku udało mu się wyreżyserować Zazdrość dla mniejszej firmy produkcyjnej Republic Pictures.
Po samobójstwie żony Marii Ray (1904-1951) powrócił do Europy i osiadł w Monachium w Niemczech Zachodnich. Swój ostatni film wyreżyserował w 1955 roku, a później pracował jako profesor w Deutsches Institut für Film und Fernsehen w Monachium. Zmarł w Monachium w 1963 roku.