Wychował się w południowej Kalifornii, gdzie zaczął grać na saksofonie w młodym wieku. Podczas pobytu w Kalifornii Jonathon rozpoczął naukę gry na saksofonie u Phila Sobela.
Od czasu przeprowadzki do Nowego Jorku Jonathon występował/nagrywał z Butchem Morrisem, Kennym Wollesenem, Billem Frisellem, Jasonem Moranem, Stevenem Bernsteinem, Medeskim, Martinem i Woodem, Uri Caine, Jimem Blackiem, Eddiem Hendersonem, Chrisem Potterem, Sex Mob, Cindi Lauper, Jesse Harrisem, Brazilian Girls, Brianem Blade, Graham Haynes, Jonas Mekas, The Nublu Orchestra, Ilhan Ersahin, Elliott Sharp, Art Baron, David Binney, Rickie Lee Jones i Red Baraat
Jonathon współprowadził również grupę "Himalayas" z perkusistą Kennym Wollesenem i występował w zespole "Now We Are Here", który jest prowadzony przez filmowca Jonasa Mekasa.