Juozas Mantas Jauniškis studiował fortepian w Narodowej Szkole Sztuki im. M.K. Čiurlionisa oraz uczęszczał na studia jazzowe w Szkole Muzycznej im. Balio Dvarionisa, gdzie jego nauczycielem był Vladimir Čakasino. W 1988 roku zdobył nagrodę na Festiwalu Jazzowym w Birštonie, dzięki czemu miał okazję uczestniczyć w prestiżowych festiwalach w Bernie, Salzburgu i Düsseldorfie. Od 2000 roku jest członkiem Europejskiej Akademii Chóralnej, a w 2004 roku ukończył studia magisterskie na Litewskiej Akademii Muzyki i Teatru w kierunku dyrygentury chóralnej. Otrzymał stypendium kulturalne Ministerstwa Kultury i kontynuował naukę w Niemczech. Pracował jako asystent dyrygenta chóru i orkiestry symfonicznej, brał udział w kursach mistrzowskich z Sylvainem Cambrelingiem (Francja) i Joshardem Dausem (Niemcy). W 2007 roku prowadził warsztaty dyrygenckie z Orchestre Philharmonique du Luxembourg, kierując Luksemburską Orkiestrą Symfoniczną i Europejską Akademią Chóralną. Od 2008 roku studiował intensywny kurs dyrygentury symfonicznej u prof. Juozo Domarko na Litewskiej Akademii Muzyki i Teatru, a od 2009 roku był stypendystą Senatu. Po raz pierwszy zadebiutował jako dyrygent z Kameralną Orkiestrą Świętego Krzysztofa w 2009 roku, a w 2010 roku z Europejską Akademią Chóralną (Bremen) jako dyrygent. W latach 2010-2011 został zaproszony do pracy jako asystent G.Rinkevičiusa w Litewskim Teatrze Narodowym Opery i Baletu przy produkcji opery G.Verdiego "Otello". Regularnie uczestniczy w różnych wydarzeniach i projektach, pracuje również jako dyrygent w Litewskim Teatrze Narodowym Opery i Baletu oraz jako dyrygent orkiestry symfonicznej Narodowej Szkoły Sztuki im. M.K. Čiurlionisa. J.M. Jauniškis dyrygował Luksemburską Filharmonią Symfoniczną, "Mendelssohn Symphonia", Litewską Narodową Orkiestrą Symfoniczną, orkiestrami LNOBT i Barokowym Teatrem Operowym, Kameralną Orkiestrą Świętego Krzysztofa, symfoniczną orkiestrą Litewskiej Akademii Muzyki i Teatru, "Collegium Musicum" i symfonicznymi orkiestrami M.K. Čiurlionisa Narodowej Szkoły Sztuki. Pracuje również z różnymi reżyserami i choreografami i ma na swoim koncie liczne wykonania i nagrania utworów różnych gatunków.