Ukończył École Nationale Supérieure des Arts Appliqués Duperré w Paryżu, Philippe Duchêne rozpoczął pracę nad serialami animowanymi na początku lat 90-tych. Pracował nad ponad 30 serialami jako dyrektor artystyczny, projektant postaci i storyboardzista.
Jako reżyser podpisał pilotażowy projekt serialu Trolle z Troi dla Dargaud Media & M6 i opracował animowany film fabularny Lwie dziecko dla Acacias Films. Następnie Philippe zaczął pisać własne projekty filmowe.
Philippe kierował projektowaniem postaci w animowanym filmie fabularnym 3D Ballerina wyprodukowanym przez Quad Cinéma, wydanym we francuskich kinach na Boże Narodzenie 2016 roku i w USA latem 2017 roku. Film zarobił ponad 100 milionów dolarów na całym świecie.
Pracował również jako główny projektant postaci w serialu telewizyjnym Young Spirou (Dupuis Audiovisuel) emitowanym na M6, jako główny projektant postaci w serialu telewizyjnym Kroniki Xiaolin (Lagardère) wydanym przez Disney Channel i Gully.
Philippe pracuje również jako dyrektor artystyczny w branży gier wideo.
W 2020 roku pracował jako projektant postaci przy serialu telewizyjnymUsagi yojimbo produkowanym przez Gaumont i Netflix, a jego pierwszy pełnometrażowy film animowany Lendarys jako twórca, reżyser i scenarzysta jest produkowany przez PM.SA.
2024. Obecnie rozwija nowe projekty filmów animowanych.