<После учебы в Парижской консерватории Дюбуа получил главную музыкальную премию Франции - Римскую премию в 1861 году. Он стал органистом и хормейстером в нескольких известных парижских церквях и одновременно был профессором консерватории, преподавая гармонию с 1871 по 1891 год и композицию с 1891 по 1896 год, когда он сменил Амбруаза Томаса на посту директора консерватории. Он продолжил строго консервативную программу своего предшественника и был вынужден досрочно уйти на пенсию после скандала, разразившегося из-за попытки преподавателей подтасовать результаты конкурса Prix de Rome, чтобы не допустить победы модерниста Мориса Равеля.
Как композитор, Дюбуа считался способным и со вкусом, но не отличался оригинальностью или вдохновением. Он надеялся сделать карьеру оперного композитора, но стал более известен благодаря своим церковным композициям. Его книги по теории музыки оказали большое влияние и оставались в употреблении в течение многих лет.