Период жизни Антокольского, проведенный в Вильнюсе, изучен недостаточно хорошо, и историки по-разному излагают его биографию. В прошлом энциклопедии и другие издания указывали год рождения - 1843. В 2000 году сотрудник Литовского государственного исторического архива обнаружил метрическую запись, подтверждающую, что Антокольскис родился в 1840 году. С 1856 по 1861 год он учился резьбе. Его первые работы заметила жена виленского генерал-губернатора Назимова, и по ее рекомендации будущий скульптор поступил в Петербургскую Академию художеств. После ее окончания он учился в Берлине, в 1871 году жил в Риме, а с 1879 года - в Париже.
Умер в Бад-Хомбурге, Германия, в 1902 году. В том же году во время перевозки его останков в Санкт-Петербург была сделана остановка на Виленском вокзале, чтобы публика могла проститься с уроженцем Вильнюса. Он был похоронен на Преображенском еврейском кладбище в Санкт-Петербурге.
Антокольский был известен своими скульптурами исторических личностей (например, русских царей: "Иван Грозный", "Петр Великий", "Иван III"), а также работами на религиозные и философские темы. Для его творчества характерны еврейские персонажи и темы ("Спор о Талмуде", "Голова еврея" и др.). Большинство произведений Антокольского хранятся в Москве и Санкт-Петербурге.
М. Антокольский жил в Вильнюсе только до 18 лет. В дальнейшем он регулярно возвращался на родину. Во время пребывания в Вильнюсе он создал свои ранние работы "Еврейский портной" и "Мизер". Ему заказали статую российской императрицы Екатерины II, которую он создал в Париже во время своих регулярных визитов в Вильнюс. Памятник был открыт после смерти скульптора в 1904 году в Вильнюсе, на Кафедральной площади, а в 1915 году демонтирован и перевезен в Россию, но не сохранился.
В 1906 году на подъезде одного из домов в Вильнюсе, на улице Диджойи, 25 (ныне район Старого города), была открыта мемориальная доска. Надпись на доске гласит, что скульптор родился и жил в этом доме. В 1976 году искусствовед Владас Дрема написал, что история, скрывающаяся за мемориальной доской, была иной. Антокольскис получил дом в качестве приданого жены после женитьбы в 1872 году и поручил управление им своему отцу. Считается, что мемориальная доска о том, что Антокольский родился в этом доме, была установлена после смерти скульптора его родственниками, получившими в наследство большой кирпичный дом, чтобы скрыть происхождение скульптора (его отец был трактирщиком), место его рождения и настоящую фамилию (Мордух). Современники и ученые утверждали, что на самом деле скульптор родился и вырос в деревянном доме своего отца на уединенной улице в Субачяусе. В 1993 году сотрудник Вильнюсского еврейского музея Генрихас Аграновскис на основании архивных документов написал, что сохранилось письмо отца скульптора, жившего в доме на улице Диджойи, 208 (к дому № 208 относится нынешний дом № 25), из-за конфликта отца скульптора с соседями по поводу строительства над их домом ледяного дома. Этот документ доказывает, что именно в этом доме родился Антокольскис.
В 2003 году, к 100-летию со дня смерти скульптора, на том же здании по адресу Вильняус Диджойи, 25, но со стороны улицы Антокольскиса (скульптура Витаутаса Заранки), была открыта еще одна мемориальная доска. На мемориальной доске на литовском и русском языках написано, что в этом доме родился и жил скульптор Маркас Антокольскис (1840-1902). Кстати, на мемориальной доске указан реальный год рождения скульптора с поправкой.
