Майкл Андерсон родился в Хуроне, штат Южная Дакота, в 10:30 вечера в ночь на Хэллоуин. Из-за генетической аномалии, известной как "несовершенный остеогенез", он вырос в инвалидном кресле. После окончания школы он путешествовал по Америке, пел за чаевые и жил в своей машине. В течение шести лет он учился в Университете Колорадо, где изучал множество предметов - от философии до микробиологии. После колледжа он начал работать на компанию Martin Marietta, устраняя неполадки в компьютерах N.A.S.A. в системе наземной поддержки космического шаттла. В это время он снял документальный фильм "Маленький Майк", который получил серебряную медаль на Международном конкурсе кино и телевидения. Вскоре после этого он переехал в Нью-Йорк, где началась его кино- и телевизионная карьера. В течение многих лет Андерсон был наиболее известен поклонникам режиссера Дэвида Линча благодаря своей работе в роли говорящего задом наперед сновидца в культовом сериале "Твин Пикс" (1990). Андерсон также работал с Линчем над экспериментальным перформансом "Индустриальная симфония № 1: Сон разбитого сердца" (1990) и телефильмом "Малхолланд Драйв" (2001). Дальнейшее признание и успех Андерсон получил в последние годы за работу над сериалом H.B.O. Carnivàle (2003).