Родившись в Марселе, Яннис Пуспурикас учился в Высшей консерватории Женевы, а затем в Цюрихской опере, где был единодушно удостоен первой премии за дирижирование. После дебюта в Женеве за дирижерским пультом "Фледермауса" в 1999 году он был назначен сэром Саймоном Рэттлом ассистентом дирижера на Глайндборнском фестивале.
С 2002 по 2004 год он занимал ту же должность в Парижской национальной опере. В 2004 году он был назначен дирижером-резидентом Национального оркестра Лиона, а в 2005 году - помощником дирижера Симфонического оркестра Мюлуза, который он занимал в течение четырех сезонов. В сентябре 2008 года Яннис Поуспурикас был назначен музыкальным руководителем Оперного балета Влаандерена, где он дирижирует очень разнообразным репертуаром, начиная с "Ночи Фигаро" и заканчивая более современными произведениями, такими как "Питер Граймс", "Кандид", "Любовь к трем апельсинам" и "Электра". До 2017 года он также сотрудничал в качестве дирижера с театром Аалто в Эссене. Яркими событиями сезона 2020/2021 станут его регулярные выступления в Театре Эрфурта и назначение дирижером Симфонического оркестра Биля Солотурна и концертным директором Театрального оркестра Биля Солотурна (TOBS) на сезон 2022/2023.