Emilis Pavilionis gimė 1993 m. gegužės 1 d. Kretingoje, bet nuo mažens gyveno Trakuose.
2016 m. baigė Lietuvos muzikos ir teatro akademijos vaidybos kursą vadovaujamą Lietuvos teatro grandės Eglės Gabrėnaitės. Specialybės dėstytojai – Saulius Bareikis ir Ieva Stundžytė. Sukurti vaidmenys akademijoje: Lukas – Yan van Eick „Identify“, rež. Ieva Stundžytė; Orsinas – V. Šekspyro „12 naktis. Arba kaip norite“, rež. Ieva Stundžytė; Mironas Samokvasovas – M. Gorki'o „Keistuoliai“, rež. Ieva Stundžytė. Juozo Miltinio dramos teatre dirba nuo 2016 m. rugpjūčio.