Gintas Žilys mokėsi Šiaulių Juliaus Janonio vidurinėje mokykloje. 1963 m. baigė Lietuvos valstybinę konservatoriją (dabar Lietuvos muzikos ir teatro akademija), aktoriaus meistriškumo specialybę. 1971 m. baigė Aukštuosius scenaristų ir režisūros kursus Maskvoje, kur režisūrą dėstė nusipelnęs Rusijos federacijos meno veikėjas Anatolijus Efrosas (rus. Анато́лий Васи́льевич Э́фрос)
