Julija Stupnianek dainavimo studijas Lietuvos muzikos ir teatro akademijoje baigė 2001 m. (prof. Irenos Laurušienės klasė). 1999 m. dalyvavo tarptautiniame prof. Ingeborgos Wamser seminare Vienoje, 2000 m. tobulinosi pas žymų baritoną H. Hagegordą (Švedija). Dalyvavo G. Preobraženskajos rusų romansų interpretavimo kursuose. 2002 m. „Opera Island“ Bornholmo vasaros akademijoje parengė Fjordilidži vaidmenį W. A. Mozarto operoje „Visos jos tokios“ (rež. Jonathanas Milleris). 2003 m. už meno projektą Lietuvos muzikos ir teatro akademija jai suteikė meno licenciato laipsnį. J. Stupnianek – LMTA docentė.
Lietuvos nacionaliniame operos ir baleto teatre debiutavo 2000 m. Violetos vaidmeniu G. Verdi operoje „Traviata“.
2000 m. dalyvavo Usedomo muzikos festivalyje (Vokietija) ir Šv. Kristoforo vasaros muzikos festivalyje Vilniuje, 2001 m. – Rostoko Baltijos šalių (Vokietija) ir Helsinkio (Suomija) festivaliuose. Vilniuje vykstančiame šiuolaikinės muzikos festivalyje „Gaida“ J. Stupnianek dalyvavo J. Juzeliūno kantatos „Gėlių kalbėjimas“ pastatyme kartu su Šv. Kristoforo kameriniu orkestru. 2004 m. sausio mėn. Liu vaidmeniu G. Puccini operoje „Turandot“ J. Stupnianek debiutavo Latvijos nacionalinėje operoje.
Solistė yra daugelio konkursų laureatė. 1999 m. ji laimėjo tarptautiniame J. Dichlerio konkurse Vienoje (III vieta), 2000 m. – tarptautiniame konkurse „Romansiada“ Maskvoje (III vieta), 2000 ir 2001 m. Vilniuje tapo V. Jonuškaitės-Zaunienės konkursų nugalėtoja (I vieta). 2003 m. „Operos švyturių“ apdovanojimuose tapo nominacijos „Metų operos viltis“ laureate. 2005 m. laimėjo III vietą tarptautiniame dainininkų ir pianistų koncertmeisterių konkurse Vilniuje, 2005 m. Kijevo tarptautiniame dainininkų konkurse (Ukraina) ir 2006 m. tarptautiniame jaunųjų operos solistų konkurse „Art and Education in the XXI-st Century“ (Suomija) pelnė Didįjį prizą. 2011 m. pavasarį tarptautinio forumo „Musical Performance and Pedagogy“, vykusio Lonigo (Italija) ir Vienoje (Austrija), vokalistų konkurse tapo Grand Prix laureate.
J. Stupnianek yra parengusi soprano partijas W. A. Mozarto, R. Schuberto, J. Haydno ir kt. oratorinio pobūdžio kūriniuose, kameriniuose koncertuose dainuoja daug vokiečių, prancūzų, italų, rusų ir lietuvių autorių dainų. Dažnai koncertuoja su ansambliais „Musica Humana“, „Vilniaus arsenalas“.
2010 m. dainavo Abros vaidmenį Lietuvos nacionalinės filharmonijos 70–mečio proga parengtoje A. Vivaldi oratorijoje „Juditos triumfas“.
Solistė dirbo su dirigentais Sauliumi Sondeckiu, Jonu Aleksa, Juozu Domarku, Liutauru Balčiūnu, Martynu Staškumi, Vytautu Viržoniu, Modestu Pitrėnu, Sesto Quatrini, Robertu Šerveniku, Donatu Katkumi, Algirdu Vizgirda, Josephu Walnigu, Bernhardu Siebereriu ir Manfredu Honecku.
Gastroliavo Austrijoje, Danijoje, Didžiojoje Britanijoje, Lenkijoje, Rusijoje, Suomijoje, Švedijoje, Šveicarijoje, Vokietijoje, Izraelyje, o su LNOBT – tarptautiniuose muzikos festivaliuose Slovėnijoje ir Italijos mieste Ravenoje. 2022 m. surengė rečitalius Bragansos teatre bei Mačedos koncertų salėje Portugalijoje.
Nuo 2005 m. Lietuvos muzikos ir teatro akademijoje dėsto dainavimą. 2010 m. vedė meistriškumo kursus Kazachijos konservatorijoje Alma Atoje, 2022 m. – Bragansos konservatorijoje (Portugalija).