Jehanas Alainas gimė muzikantų šeimoje, o jo tėvas Albertas Alainas taip pat buvo kompozitorius ir vargonininkas. Jehanas vargonuoti pradėjo būdamas 11 metų, o vėliau studijavo Nacionalinėje konservatorijoje, kur mokėsi pas Marcel Dupré ir Paul Dukas. Jis gavo pirmąsias premijas įvairiose srityse, įskaitant harmoniją, kontrapunktą, fugą ir kompoziciją. Alainas tapo Maisons-Laffitte vargonininku 1936 m., bet, deja, mirė jaunas, būdamas 29 metų, gindamas Saumur. Jis paliko žmoną ir tris vaikus, įskaitant Marie-Claire Alain. Teigiama, kad kai kurie jo rankraščio puslapiai po jo mirties buvo nupūsti ir paimti valstiečių vaikų. Paskutiniai Alaino darbai vargonams „Trois Danses“, įskaitant antrąją dalį „Deuils“, buvo jo tragiško likimo nuojauta.
