L. Vilkončius – produktyvus ir įvairiapusis kompozitorius, sukūręs nemažai kūrinių chorui, orkestrui, ansambliams. Parašė operą vaikams „Paukštė", baletą „Piteris Penas“ (pagal V.Palčinskaitės libretą), roko operą „Eglė - žalčių karalienė“ (pagal S. Gedos libretą).
Parašė muziką dvylikai tetaro spektaklių ir aštuoniems kino filmams („Turtuolis, vargšas...“, „Kelionė į rojų“, „Chameleono žaidimai“, „Amerikietiška tragedija“, animaciniai filmas „Baubas“, „Senelės pasaka“ ir kt.).
Organizavo festivalius „Sing group Jazz“ Panevėžyje ir „Baby Jazz“ Vilniuje, vadovavo ir dainavo vokaliniame trio (su dukromis). Įrašė autorinę plokštelę „Požeminės upės“, autorinį kompaktinį diską ir kasetę „Tau, mano meile“, su valstybiniu choru „Vilnius“ kompaktinę plokštelę „Neregėtas Vilkončius“.
L. Vilkončius parašė virš 90 dainų („Ar išsaugosi mano meilę“, „Laivas“, „O mes skubam“, „Dideli nykštukai“, „Mažos mašinėlės“, „Naktis bulvelėms žydint“ ir kt.
