Lavignacas gimė Paryžiuje, mokėsi Paryžiaus konservatorijoje pas Antuaną Fransua Marmontelį, Fransua Benoistą ir Ambrozą Tomą, vėliau dėstė harmoniją. Tarp jo mokinių buvo Henri Casadesus, Claude'as Debussy, Vincent'as d'Indy, Amédée Gastoué, Philippas Jarnachas, Henri O'Kelly, Gabrielis Pierné, Wadia Sabra, Florentas Schmittas. Žr: Muzikos mokinių sąrašas pagal mokytoją:
1864 m. kovą, būdamas aštuoniolikos metų, jis iš armonikos dirigavo privačiai Gioachino Rossini "Petite messe solennelle" premjerai.
Jo sutrumpintas veikalas "La Musique et les Musiciens", muzikos gramatikos ir medžiagos apžvalga, buvo perspausdinamas ir praėjus daugeliui metų po jo mirties. Jame jis apibūdino konkrečias instrumentų ir kiekvienos tonacijos savybes, šiek tiek panašiai, kaip tai padarė Berliozas ir Gevaertas (Traité d'orchestration, Gand, 1863, p. 189)
