Yannickas dirbo su daugeliu garsiausių Europos kolektyvų, glaudžiai bendradarbiauja su Berlyno filharmonijos orkestru, Vienos filharmonijos orkestru, "Bayerischer Rundfunk Sinfonieorchester" ir Europos kameriniu orkestru; 2008-2014 m. jis taip pat buvo Londono filharmonijos orkestro vyriausiasis kviestinis dirigentas. Daug kartų dalyvavo "BBC Proms" ir daugelyje Europos festivalių, tarp jų - Edinburgo, Liucernos, Zalcburgo ir Grafeneggo (Viena). Šiaurės Amerikos vasaros festivaliuose - Niujorko festivalyje "Mostly Mozart", Lanaudiere, Vail ir Saratoga, taip pat Domaine Forget festivalyje Šarlevua (Charlevoix). Su Filadelfijos orkestru jis reguliariai vyksta į Karnegio salę, kur 2019-2020 m. buvo paskirtas perspektyviuoju menininku. Jis taip pat veda meistriškumo kursus, ypač dviejose garsiausiose institucijose - Filadelfijos Curtiso institute ir Niujorko Julliardo mokykloje. Kvebeke jis vadovauja jaunųjų dirigentų akademijai, susijusiai su orkestru "Orchestre Métropolitain" ir glaudžiai bendradarbiaujančiai su Domaine Forget vasaros festivaliu.
Dėl ilgalaikio bendradarbiavimo su Baden Badeno vasaros festivaliu "La Capitale d'été" per kelerius metus įvyko keli koncertai ir operų įrašai su Europos kameriniu orkestru (žr. kitą pastraipą), taip pat visos L. van Beethoveno simfonijos (2021 m. vasarą) ir J. Brahmso ciklas (2022 ir 2023 m. vasarą).
Jis nuolat diriguoja Filadelfijos ir Roterdamo orkestrams, taip pat Europos kameriniam orkestrui Azijos ar Europos gastrolėse; 2017 m. lapkritį dirigavo Monrealio orkestrui pirmosiose Europos gastrolėse, kurios sulaukė didžiulės sėkmės, o 2019 m. lapkritį - itin prestižinėse Amerikos gastrolėse su dainininke Joyce DiDonato; planuojamos antrosios Amerikos gastrolės su Monrealio orkestru, kurios 2024 m. kovą nuves į Carnegie Hall. 2023 m. vasarą jis dirigavo labai sėkmingoms Europos gastrolėms su MET orkestru, kuris jau daugelį metų nekeliavo; planuojamos gastrolės Azijoje.
Yannickas taip pat gerai jaučiasi tiek operoje, tiek koncerte. Nuo 2000 m. iki 2004 m. iššiepęs dantis Monrealio operoje "Popėjos karūnavime", "Sevilijos kirpėjuje", "Cosi fan tutte", Pelléas et Mélisande ir L'Elisir d' amore, epizodiškai grįžta į spektaklius Wozzeck, Madame Butterfly, Salomé ir Elektra. Zalcburgo festivalyje jis debiutavo 2008 m. su nauju Gounod "Romeo ir Džuljetos" pastatymu, o 2010 m. ir 2011 m. grįžo ten pat su Mozarto "Don Žuanu". Būtent 2009-2010 m. sezone jis debiutavo Metropoliteno operoje (MET) naujame G. Bizet operos "Karmen" pastatyme; Vėliau kiekvieną sezoną grįždavo ten diriguoti Don Carlo, Faustą, Traviatą, Rusalką, Otello, Der Fliegende Hollander, Parsifalį ir Elektrą, o po to tapo jos muzikos vadovu; eidamas šias pareigas jis dirigavo "Traviatą", "Peleną ir Melisandą", "Karmeličių dialogus", "Turandot", "Vozeką", "Toską", "Mano kauluose užgesusi ugnis", "Euridikę" ir "Don Karlą" (prancūzų kalba). Be to, 2022-2023 m. sezone jis paeiliui diriguos "Valandas", "Lohengriną", "Čempioną" ir "La Bohême". 2023-2024 m. sezone jis diriguos "Dead Man Walking", "Florencia in el Amazonas", "La Forza del Destino" ir "Roméo et Juliette
Jis yra dirigavęs Milano "Teatro alla Scala", Londono Karališkojoje operoje (Covent Garden, Londonas), Amsterdamo Nyderlandų operoje ir Vienos valstybinėje operoje (Viena). Su Roterdamo filharmonijos orkestru prieš pat pandemijos pradžią jis dirigavo pusiau teatralizuotą Richardo Strausso Die fraù ohne schatten versiją. 2011 m. jis ėmėsi paskutinių Mozarto operų ciklo Baden Badeno Festspielhaus, visas jas "gyvai" įrašė Deutsche Grammophon; iki šiol pasirodė šie pavadinimai: Di Zauberflöte; La Clemenza di Tito; Le Nozze di Figaro; Entführung aus dem Serail; Cosi fan tutte; Don Giovanni; Don Giovanni, dauguma jų - su Europos kameriniu orkestru. 2022 m. balandį su Roterdamo filharmonijos orkestru dirigavo Richardo Vagnerio Rheingoldą koncertinėje versijoje per gastroles Roterdame, Paryžiuje, Dortmunde ir Baden Badene, kurios sulaukė aukščiausių įvertinimų visam pastatymui. Panašios gastrolės planuojamos ir su Richardo Wagnerio "Walküre" 2024 m. kovą.
Apie Yannicko Nézet-Séguino karjerą yra sukurti keli filmai ar siužetai, kurių išsamiausias, išleistas 2021 m., pavadinimu Yannick, an Artist's Journey, kurį prodiusavo Susan Froamke ir kurį parengė MET. Be to, 2022 ir 2023 m. Yannickas kaip dirigavimo konsultantas dalyvavo kuriant du filmus: Maestro, amerikiečių režisieriaus Bradley Cooperio (kuris taip pat atlieka pagrindinį vaidmenį) filme, kuriame taip pat vaidina Carrie Mulligan, pasakojančiame apie Leonardo Bernsteino gyvenimą (2024 m. lapkritį pasirodys "Netflix"); ir Happy Days, Kvebeko režisierės Chloé Robichaud filme, kuriame jauno dirigento vaidmenį atlieka Sophie Desmarais.
Maestro įrašinėja tik "Deutsche Grammophon". 2013 m. rugsėjį pasirodė pirmasis jo simfoninis įrašas po šia prestižine etikete; ta proga jis vadovauja Filadelfijos orkestrui, kuris nuo 1997 m. nebuvo įrašinėjęs po garsia leidybine kompanija; jų įrašas Stravinskio ("Pavasario apeigos") -Stokowskio (Bacho ir Stravinskio transkripcijos) sulaukė didžiulės sėkmės. Su Europos kameriniu orkestru įrašė visas Mendelsono simfonijas, taip pat visus Šumanno simfonijų kūrinius; su Rotterdamo filharmonijos orkestru - suvenyrinę dėžutę; su Daniilu Trifonovu ir Filadelfijos orkestru - du diskus su 4 Rachmaninovo fortepijoniniais koncertais. Jo DG diskografijoje yra ir keletas kitų įrašų, tarp jų Čaikovskio su Lisa Batiashvili ir Roterdamo filharmonijos orkestru; Prokufjevo vizijos su Lisa Batiashvili ir Europos kameriniu orkestru. Po kelių Leonardo Bernsteino kūrinio Mass atlikimų scenoje Yannickas diriguoja Filadelfijos orkestrui bei visiems dalyviams įraše, kuris buvo išleistas 2018 m. kovo mėn. 2021 m., vis dar su Filadelfijos orkestru, jis griežia Florence Price 1 ir 3 simfonijas; šis diskas jam pelnė "Grammy" apdovanojimą už "geriausią orkestrinį atlikimą". Su tuo pačiu orkestru jis įrašė albumą Price-Dawson, nominuotą 2024 m. "Grammy" apdovanojimui.
Su "ATMA Classique" ir Monrealio metropolijos orkestru, su kuriuo jis pradėjo įrašinėti 2000 m., specialiame dėžutės rinkinyje surinktos visos per daugelį metų įrašytos Brucknerio simfonijos. Vėliau jis kartu su jais ėmėsi Sibelijaus ciklo, kurio naujausias albumas bus išleistas 2024 m. Grįžimas prie fortepijono pandemijos metu leidžia jo pirmajam soliniam fortepijoniniam albumui Introspection išvysti dienos šviesą "Deutsche Grammophon" leidykloje (2021 m. vasaris). Kitus įrašus galima rasti įvairiose leidyklose: Roterdamo filharmonijos orkestras (EMI Classics, BIS); Londono filharmonijos orkestras (LPO leidykla); Monrealio metropoliteno orkestras (ATMA Classic); Berlyno filharmonijos orkestras (namų leidykla); Vienos filharmonijos orkestras (Sony Classical); etc