Tarptautinio ARD konkurso Miunchene pirmosios premijos laureatas, tarptautinio konkurso "Prahos pavasaris" laureatas, Europos Parlamento ir Europos Tarybos globojamo prizo laimėtojas.
Andrzejus Baueris gimė Lodzėje, kur baigė studijas pas Kazimierzą Michaliką. Muzikinį išsilavinimą jis tęsė, daugelyje meistriškumo kursų bendradarbiaudamas, pavyzdžiui, su André Navarra, Milošu Sadlo ir Danieliu Szafranu. Witoldo Lutosławskio stipendijos dėka jis taip pat baigė dvejų metų kursus Londone pas Williamą Pleethą.
Andrzejus Baueris surengė rečitalius Amsterdame, Paryžiuje, Hamburge ir Miunchene, grojo su simfoniniais orkestrais, įskaitant Miuncheno filharmonijos orkestrą, Neapolio RAI orkestrą, Strasbūro filharmonijos orkestrą, Štutgarto radijo simfoninį orkestrą ir Berlyno radijo simfoninį orkestrą. Jis koncertavo kaip solistas su daugeliu Lenkijos simfoninių ir kamerinių orkestrų, o tokie kolektyvai kaip Nacionalinės filharmonijos orkestras ir "Sinfonia Varsovia" kvietė jį kaip solistą į savo koncertines keliones po Europą.
Andrzejus Baueris įrašinėjo muziką daugeliui Lenkijos ir kitų šalių radijo ir televizijos stočių. Jis dalyvavo tarptautiniuose festivaliuose, koncertavo daugelyje Europos šalių, taip pat Jungtinėse Amerikos Valstijose ir Japonijoje.
Atlikėjo įrašas su Šuberto, Bramso ir Šumano kūriniais (Koch/Schwann) pelnė ketvirčio Vokietijos įrašų kritikų apdovanojimą. Vėlesnėse jo kompaktinėse plokštelėse skambėjo Šostakovičiaus, Prokofjevo, Stravinskio, Messiaeno, Panufniko kūriniai, taip pat Witoldo Lutosławskio Koncerto violončelei. 2000 m. pasirodė pirmasis Lenkijoje visų Bacho siuitų violončelei įrašas (dviejose kompaktinėse plokštelėse), Bauerio įrašytas leidyklai "CD Accord", už kurį atlikėjas 2000 m. pelnė Lenkijos fonografijos akademijos Frydricho apdovanojimą.
Platus atlikėjo repertuaras apima daug šiuolaikinės ir naujos muzikos kūrinių, įskaitant specialiai jam sukurtus kūrinius. 2002 m. Varšuvos rudens festivalyje Andrzejus Baueris surengė jo inspiruotų kūrinių violončelei solo ir elektroninėms medijoms premjerų rečitalį. Tuomet pradėtą projektą Cellotronicum menininkas tęsia iki šiol, jo rezultatas - nauji įrašai ir dar daugiau premjerų, pristatytų svarbiausiose Europos šiuolaikinės muzikos scenose. Antrasis projekto "Cellotronicum" leidimas "Varšuvos rudenyje" pelnė "Orfėjaus" prizą 2006 m.
Andrzejus Baueris yra Varšuvos Fryderyko Chopino muzikos universiteto ir Bydgoščiaus Felikso Nowowiejskio muzikos akademijos profesorius, kur vadovauja violončelės klasei. Be to, jis yra Varšuvos violončelės grupės įkūrėjas ir meno vadovas.
Vis daugiau laiko skiria muzikos komponavimui ir improvizacijoms.