Dainuoti pradėjęs berniukų chore “Ąžuoliukas”, 1985 m. Arūnas Malikėnas baigė studijas profesoriaus Virgilijaus Noreikos klasėje Lietuvos muzikos ir teatro akademijoje.
Tais pačiais metais debiutavo Lietuvos nacionaliniame operos ir baleto teatre, nuo tada yra jo solistas. Per daugiau kaip dvidešimt metų solisto repertuare sukaupta per 60 vaidmenų įvairiose operose.
2009 m. už talentą ir profesinį meistriškumą kuriant mažus vaidmenis buvo apdovanotas „Auksinių scenos kryžių“ apdovanojimu. Tais pačiais metais už profesionaliai atliekamus antraplanius vaidmenis (Dulcamara („Meilės eleksyras“), Dankairas („Karmen“) ir kt. išrinktas „Geriausiu operos antraplanių vaidmenų solistu“ ir apdovanotas „Operos Švyturiu“.
1992 – 2000 m. Lietuvos muzikos ir teatro akademijoje dėstė dainavimą, yra LNOBT choro vokalo pedagogas.
Be operinės veiklos, A.Malikėnas rengia partijas stambiuose simfoniniuose instrumentiniuose kūriniuose, oratorinio žanro kompozicijose. Dainavo G. F. Handelio oratorijoje „Samsonas“, G. Puccini Messa di Gloria, G. Mahlerio VIII simfonijoje, L. van Beethoveno IX simfonijoje, C. Orffo Carmina burana.
A. Malikėnas įrašė CD diskus: E.Wolf-Ferrari „Susanės paslaptis“, J. Gaižausko „Buratinas“(Katinas), B. Kutavičiaus „Lokys“ (Maršalka), M. Petrausko „Birutė“ (Vaidyla).
Kartu su teatro operos trupe solistas dalyvavo G. Verdi festivalyje Le Roncole, Italijoje(1992), Olandijoje, Savonlinnos operos festivalyje Suomijoje, (1993), artisto gastrolių geografija apima apie 30 pasaulio šalių – JAV, Lotynų Amerika, Vokietija, Austrija, Ispanija, Olandija, Belgija, Rusija, Švedija ir tt.
