Profesorius Eduardas Gabnys gimė 1952 m. kovo 17 d. Panevėžio mieste. 1967 m. baigė Panevėžio vaikų muzikos mokyklą, toliau mokėsi Panevėžio aukštesniojoje muzikos mokykloje ir 1971 m. baigė J. Tallat-Kelpšos aukštesniąją muzikos mokyklą. Tais pačiais metais jis įstojo į Lietuvos muzikos ir teatro akademijos Liaudies instrumentų katedrą, kur 1976 m. baigė doc. dr. A. Baikos akordeono klasę. Tarp 1982 ir 1986 m. jis studijavo Ukrainos P. Čaikovskio nacionalinės muzikos akademijoje, kurioje stažuojosi akordeono ir kamerinio ansamblio klasėse. Jo pedagogais buvo M. Davydovas, M. Ryzolis ir I. Jaškevičius. Gabnys pradėjo meninę veiklą dar studijų metais, grojo liaudies instrumentų ansamblyje "Sutartinė" nuo 1972 iki 1980 metų. Po to, kaip solistas, jis aktyviai dalyvavo Nacionalinės filharmonijos rengiamuose koncertuose, Lietuvos kompozitorių autoriniuose koncertuose ir padarė įrašus Lietuvos radijo ir plokštelių studijose. Nuo 1978 m. jis pradėjo griežti duetu su akordeonistu Genadijumi Savkovu ir surengė apie 700 dueto koncertų Lietuvoje, taip pat koncertavo 32 pasaulio šalyse, įskaitant Europą, Šiaurę ir Pietus Amerikos, Australiją ir Naująją Zelandiją. Jie įrašė vinilinę ir kompaktinę plokšteles, keturias garsaus juostas, daug radijo bei televizijos įrašų. Gabnys taip pat grojo Tarptautiniame Baltijos akordeonistų kvintete "Excelsior" nuo 1999 m. Jis dėsto akordeoną, kamerinį ansamblį ir instrumentaciją Lietuvos muzikos ir teatro akademijoje nuo 1977 m. Jo studentai yra daugelio tarptautinių konkursų laureatai. Gabnys yra aktyvus lietuviškos muzikos propaguotojas, kuris pirmasis atliko originalių kūrinių akordeonų duetui, įskaitant kompozitorių J. Tamulionio, F. Bajoro, V. Ločerio, V. Bagdono, V. Mikalausko, A. Klovos, V. Juozapaičio kūrybą, taip pat Ukrainos kompozitoriaus V. Zubickio kūrinius. Gabnys buvo tarptautinių akordeonistų konkursų Italijoje ir Vokietijoje nugalėtojas su savo ansambliu ir yra apdovanotas specialiu prizu už geriausias Argentiniečių kompozitoriaus Astor Piazzollos kūrinių aranžuotes. Gabnys turi docento pedagoginį vardą nuo 1991 m. ir profesoriaus vardą nuo 1998 m. Nuo 1994 m. iki 2005 m. jis buvo LMTA studijų prorektoriumi, nuo 2005 m. iki 2011 m. buvo rektoriu. Gabnys taip pat daugelį metų buvo renkamas į LMTA senatą ir tarybą, Lietuvos muzikų sąjungos tarybą ir yra tarptautinių aukštųjų mokyklų studijų programų akreditacijos ekspertas. Gabnys taip pat dalyvavo Lietuvos akordeonistų asociacijos steigimo iniciatyvinėje grupėje ir yra vienas iš šios organizacijos vadovų. Jis taip pat yra tradicinių Vilniaus akordeono muzikos festivalių organizatorius, Lietuvos ir tarptautinių akordeonistų konkursų organizacinės komisijos pirmininkas ir Palangos vasaros seminarų vadovas, lektorius