1999 m. įstojo į Nacionalinę M. K. Čiurlionio menų mokyklą, mokytojo Donaldo Račio klasę. 2004 m. pelnė I premiją Kamerinių ansamblių konkurse „Pavasario sonata“ Vilniuje, tais pačiais metais tapo Tarptautinio B. Dvariono konkurso laureate. 2005 m. E. Žukauskaitė studijavo Lietuvos muzikos ir akdemijoje, prof. Petro Geniušo klasėje.
Ji taip pat yra viena iš prof. Mūzos Rubackytės įkurtos F. Liszto asociacijos “Lisztuania” projektų organizatorių. Pianistė dalyvavo festivalyje „Festspiele europäische wochen Passau“, kaip solistė ir įvairių kamerinių ansamblių narė bei koncertmeisterė.
Studijų metais ji įsitraukė į įvairius projektus, kurių pagrindinės idėjos - muzikos ir gyvenimo filosofijos persipynimas - jos nepaleidžia ir šiandien. Šiuo metu gyvendama Paryžiuje kartu su šių dienų kompozitoriais, filosofais ir rašytojais ji tęsia edukacinę veiklą, kuria projektus ir rengia koncertus tiek Prancūzijoje, tiek už jos ribų.
Emilija savo atlikėjos meną tobulino ir prestižinėje A. Cortot Paryžiaus konservatorijoje, kurioje 2022 metais įgijo ir atlikėjos - solistės diplomą.