užaugo Pietų Kalifornijoje, kur anksti pradėjo groti saksofonu. Gyvendamas Kalifornijoje Džonatonas pradėjo mokytis groti saksofonu pas Filą Sobelį.
Nuo persikėlimo į Niujorką Jonathonas grojo/įrašinėjo su Butchu Morrisu, Kenny Wollesenu, Billu Frisellu, Jasonu Moranu, Stevenu Bernsteinu, Medeski, Martinu ir Woodu, Uri Caine'u, Jimu Blacku, Eddie Hendersonu, Chrisu Potteriu, Sex Mob, Cindi Lauper, Jesse Harrisu, Brazilian Girls, Brianu Blade'u, Grahamui Haynesui, Jonui Mekui, "The Nublu Orchestra", Ilhanui Ersahinui, Elliottui Sharpui, Artui Baronui, Davidui Binney, Rickie Lee Jonesui ir Red Baraatui
Jonathonas taip pat kartu su būgnininku Kenny Wollesenu vadovauja grupei "Himalayas" ir groja ansamblyje "Now We Are Here", kuriam vadovauja režisierius Jonas Mekas.