Juozas Mantas Jauniškis studijavo fortepijoną Nacionalinėje M.K. Čiurlionio menų mokykloje ir lankė džiazo studiją Balio Dvariono muzikos mokykloje, kurioje buvo vadovaujamas Vladimiro Čakasino. 1988 metais tapo laureatu Birštono džiazo festivalyje, dėl ko dalyvavo prestižiniuose festivaliuose Bern, Salzburg ir Düsseldorf. Nuo 2000 metų yra Europos ChorAkademie narys, o 2004 metais baigė magistro studijas Lietuvos muzikos ir teatro akademijoje choro dirigavimo specialybėje. Gavo kultūros ministerijos stipendiją, o studijas tęsė Vokietijoje. Dirbo choro ir simfoninio orkestro dirigento asistentu ir vadovas bei dalyvavo meistriškumo kursuose vedamų Sylvain Cambreling (Prancūzija) ir Joshard Daus (Vokietija). 2007 metais dirigo Orchestre Philharmonique du Luxembourg dirigavimo meistriškumo kurse, vadovaujant Luksemburgo simfoniniam orkestrui ir EuropaChorAkademie. Nuo 2008 metų studijavo Lietuvos muzikos ir teatro akademijoje prof. Juozo Domarko intensyvios simfoninio dirigavimo klasėje, o nuo 2009 metų buvo senato stipendiatas. Pirmą kartą debiutavo su Švento Kristoforo kameriniu orkestru 2009 metais, o 2010 metais kaip dirigentas su EuropaChorAkademie (Bremen). Tarp 2010 ir 2011 metais buvo pakviestas dirbti Lietuvos Nacionalinio operos ir baleto teatro (LNOBT) statant G.Verdi operą “Otello” G.Rinkevičiaus asistentu. Nuolat dalyvauja įvairiuose renginiuose ir projektuose, taip pat dirba kaip Lietuvos Nacionalinio operos ir baleto teatro dirigentas ir Lietuvos Nacionalinės M.K. Čiurlionio menų mokyklos simfoninio orkestro dirigentas. J.M.Jauniškis dirigo Liuksemburgo filharmonijos simfoniniam orkestrui, „Mendelssohn Symphonia“, Lietuvos nacionaliniam simfoniniam orkestrui, LNOBT ir Baroko operos teatro orkestrams, Šv. Kristoforo kameriniam orkestrui, Lietuvos muzikos ir teatro akademijos simfoniniam orkestrui, „Collegium musicum“ ir M. K. Čiurlionio menų mokyklos simfoniniams orkestrams. Taip pat dirba su įvairiais režisieriais ir choreografais ir yra gausiai atlikęs ir įrašęs įvairių žanrų kūrinius.