Alesandrijoje studijavęs pas valtornos mokytoją Giacomo Zoppi ir kompozicijos mokytoją Felice Quaranta, vėliau Marcello tęsė dirigavimo studijas Sienos Chigiana akademijoje pas Igorį Markevičių ir Franco Ferrara.
Diriguodamas visiems žymiausiems Italijos orkestrams, jis buvo dažnas svečias prestižiškiausiose pasaulio scenose, įskaitant "Concertgebouw", "La Scala", Hamburgo "Musikhalle", "Filharmoniehalle" (Miunchenas, Berlynas, Manheimas), "Royal Albert Hall", "Festival Opera Hall" (Veksfordas) ar "Palais des Beaux Arts" (Briuselis). Jis dirigavo daugeliui užsienio orkestrų įvairiose pagrindinėse Europos, JAV, Kanados, Australijos, Naujosios Zelandijos, Rusijos ar Kinijos koncertų salėse. Jis bendradarbiavo su tokiais žymiais menininkais kaip Rostropovičius, Geringas, Bocelli ar Rampalis.
Marcello Rotos operų repertuare - daugiau kaip trisdešimt kūrinių, ypatingą dėmesį skiriant Rossini, Bellini, Donizetti, Verdi ir Puccini. Nuo 2004 m. Marcello Rota yra pagrindinis kviestinis Čekijos nacionalinio simfoninio orkestro dirigentas.
Neseniai su šiuo orkestru jis pasirodė "JVC Victor Entertainment" įrašų kompanijai, Prahos "Proms" festivalyje, taip pat akomponavo Andrea Bocelli koncertuose daugiau nei keturiasdešimtyje pasaulio kultūros centrų.